Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3727J3QM54 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3727J3QM54 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3727J3QM54 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3727J3QM54 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3727J3QM54 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3727J3QM54 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3727J3QM54 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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Gm3727J3QM54 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3727J3QM54 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3727J3QM54 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3727J3QM54 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3727J3QM54 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3727J3QM54 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3727J3QM54 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gm3727J3QM54 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3727J3QM54 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3727J3QM54 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3727J3QM54 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3727J3QM54 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3727J3QM54 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3727J3QM54 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3727J3QM54 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm3727J3QM54 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm3727J3QM54 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm3727J3QM54 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm3727J3QM54 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm3727J3QM54 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm3727J3QM54 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gm3727J3QM54 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm3727J3QM54 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm3727J3QM54 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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