Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms