Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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Gm20830J3KML6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20830J3KML6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm20830J3KML6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm20830J3KML6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm20830J3KML6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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