Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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