Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G2

Usp17ld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein D, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17ldG5E8G2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp17ldG5E8G2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp17ldG5E8G2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp17ldG5E8G2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp17ldG5E8G2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp17ldG5E8G2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp17ldG5E8G2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp17ldG5E8G2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp17ldG5E8G2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp17ldG5E8G2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp17ldG5E8G2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp17ldG5E8G2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp17ldG5E8G2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp17ldG5E8G2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp17ldG5E8G2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp17ldG5E8G2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp17ldG5E8G2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp17ldG5E8G2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp17ldG5E8G2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp17ldG5E8G2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp17ldG5E8G2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp17ldG5E8G2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp17ldG5E8G2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp17ldG5E8G2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp17ldG5E8G2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp17ldG5E8G2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp17ldG5E8G2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp17ldG5E8G2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp17ldG5E8G2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp17ldG5E8G2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms