Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pcf11G3X9Z4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pcf11G3X9Z4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms