Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U1

Obox6, Oocyte specific homeobox 6, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox6G3X9U1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Obox6G3X9U1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Obox6G3X9U1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Obox6G3X9U1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Obox6G3X9U1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Obox6G3X9U1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Obox6G3X9U1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Obox6G3X9U1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Obox6G3X9U1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Obox6G3X9U1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Obox6G3X9U1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Obox6G3X9U1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Obox6G3X9U1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Obox6G3X9U1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Obox6G3X9U1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Obox6G3X9U1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Obox6G3X9U1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Obox6G3X9U1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Obox6G3X9U1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Obox6G3X9U1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Obox6G3X9U1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Obox6G3X9U1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Obox6G3X9U1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Obox6G3X9U1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Obox6G3X9U1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Obox6G3X9U1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Obox6G3X9U1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Obox6G3X9U1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Obox6G3X9U1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Obox6G3X9U1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Obox6G3X9U1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Obox6G3X9U1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Obox6G3X9U1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Obox6G3X9U1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Obox6G3X9U1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Obox6G3X9U1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Obox6G3X9U1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms