Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zkscan2G3X952 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms