Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ScaperF8VQ70 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms