Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28038F7BCN9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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