Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8220F6YKI2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms