Protein–RNA interactions for Protein: F6W043

Vmn2r40, Vomeronasal 2, receptor 40, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r40F6W043 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn2r40F6W043 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn2r40F6W043 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn2r40F6W043 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn2r40F6W043 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn2r40F6W043 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn2r40F6W043 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn2r40F6W043 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn2r40F6W043 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn2r40F6W043 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn2r40F6W043 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn2r40F6W043 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn2r40F6W043 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn2r40F6W043 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn2r40F6W043 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn2r40F6W043 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn2r40F6W043 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn2r40F6W043 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn2r40F6W043 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn2r40F6W043 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn2r40F6W043 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn2r40F6W043 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn2r40F6W043 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn2r40F6W043 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn2r40F6W043 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn2r40F6W043 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn2r40F6W043 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn2r40F6W043 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn2r40F6W043 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn2r40F6W043 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn2r40F6W043 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn2r40F6W043 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn2r40F6W043 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn2r40F6W043 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn2r40F6W043 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn2r40F6W043 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn2r40F6W043 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn2r40F6W043 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn2r40F6W043 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r40F6W043 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms