Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syngap1F6SEU4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms