Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm29094F6Q785 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm29094F6Q785 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm29094F6Q785 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm29094F6Q785 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm29094F6Q785 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm29094F6Q785 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm29094F6Q785 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm29094F6Q785 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm29094F6Q785 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm29094F6Q785 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm29094F6Q785 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm29094F6Q785 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm29094F6Q785 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm29094F6Q785 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm29094F6Q785 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm29094F6Q785 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm29094F6Q785 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm29094F6Q785 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm29094F6Q785 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm29094F6Q785 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm29094F6Q785 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm29094F6Q785 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm29094F6Q785 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm29094F6Q785 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm29094F6Q785 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm29094F6Q785 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm29094F6Q785 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm29094F6Q785 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm29094F6Q785 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm29094F6Q785 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm29094F6Q785 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm29094F6Q785 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm29094F6Q785 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm29094F6Q785 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm29094F6Q785 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms