Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms