Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms