Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3J7

Gm3020, Predicted gene 3020, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3020E9Q3J7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3020E9Q3J7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3020E9Q3J7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3020E9Q3J7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3020E9Q3J7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3020E9Q3J7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3020E9Q3J7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3020E9Q3J7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3020E9Q3J7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3020E9Q3J7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3020E9Q3J7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3020E9Q3J7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3020E9Q3J7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3020E9Q3J7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3020E9Q3J7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3020E9Q3J7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3020E9Q3J7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3020E9Q3J7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3020E9Q3J7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3020E9Q3J7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3020E9Q3J7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3020E9Q3J7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3020E9Q3J7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3020E9Q3J7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3020E9Q3J7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3020E9Q3J7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3020E9Q3J7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3020E9Q3J7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3020E9Q3J7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3020E9Q3J7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3020E9Q3J7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3020E9Q3J7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3020E9Q3J7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3020E9Q3J7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3020E9Q3J7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3020E9Q3J7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3020E9Q3J7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3020E9Q3J7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3020E9Q3J7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3020E9Q3J7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3020E9Q3J7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms