Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms