Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd1E9PZ26 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd1E9PZ26 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms