Protein–RNA interactions for Protein: E9PWK2

Vmn1r224, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r224E9PWK2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r224E9PWK2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r224E9PWK2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r224E9PWK2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r224E9PWK2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r224E9PWK2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r224E9PWK2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r224E9PWK2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r224E9PWK2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r224E9PWK2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r224E9PWK2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r224E9PWK2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r224E9PWK2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r224E9PWK2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r224E9PWK2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r224E9PWK2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r224E9PWK2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r224E9PWK2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r224E9PWK2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms