Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
5430403G16RikD3Z5L4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
5430403G16RikD3Z5L4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
5430403G16RikD3Z5L4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
5430403G16RikD3Z5L4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
5430403G16RikD3Z5L4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
5430403G16RikD3Z5L4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
5430403G16RikD3Z5L4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
5430403G16RikD3Z5L4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
5430403G16RikD3Z5L4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
5430403G16RikD3Z5L4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
5430403G16RikD3Z5L4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
5430403G16RikD3Z5L4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
5430403G16RikD3Z5L4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
5430403G16RikD3Z5L4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
5430403G16RikD3Z5L4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms