Protein–RNA interactions for Protein: D3Z257

Gm5930, Predicted gene 5930, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5930D3Z257 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5930D3Z257 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5930D3Z257 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5930D3Z257 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5930D3Z257 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5930D3Z257 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5930D3Z257 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5930D3Z257 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5930D3Z257 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5930D3Z257 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5930D3Z257 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5930D3Z257 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5930D3Z257 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5930D3Z257 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5930D3Z257 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5930D3Z257 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5930D3Z257 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5930D3Z257 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5930D3Z257 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5930D3Z257 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5930D3Z257 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5930D3Z257 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5930D3Z257 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm5930D3Z257 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5930D3Z257 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms