Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms