Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms