Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apba1B2RUJ5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms