Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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