Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf3B2RQG2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms