Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms