Protein–RNA interactions for Protein: B1AVU7

Gm13178, Predicted gene 13178, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13178B1AVU7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm13178B1AVU7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm13178B1AVU7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms