Protein–RNA interactions for Protein: A2RSY6

Trmt1l, TRMT1-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1lA2RSY6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trmt1lA2RSY6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trmt1lA2RSY6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trmt1lA2RSY6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms