Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms