Protein–RNA interactions for Protein: A2AIR5

Grin3a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3aA2AIR5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Grin3aA2AIR5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Grin3aA2AIR5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin3aA2AIR5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin3aA2AIR5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin3aA2AIR5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin3aA2AIR5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin3aA2AIR5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin3aA2AIR5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin3aA2AIR5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin3aA2AIR5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin3aA2AIR5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin3aA2AIR5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin3aA2AIR5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin3aA2AIR5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin3aA2AIR5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin3aA2AIR5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin3aA2AIR5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin3aA2AIR5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin3aA2AIR5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin3aA2AIR5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms