Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem185aA2AF53 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmem185aA2AF53 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmem185aA2AF53 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms