Protein–RNA interactions for Protein: A2A5X4

Krtap29-1, Keratin-associated protein 29-1, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap29-1A2A5X4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krtap29-1A2A5X4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms