Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nlrp1bA1Z198 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrp1bA1Z198 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms