Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms