Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms