Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Trbv30A0A0B4J1P1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Trbv30A0A0B4J1P1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Trbv30A0A0B4J1P1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Trbv30A0A0B4J1P1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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