Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Speer3W4VSP1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Speer3W4VSP1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Speer3W4VSP1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Speer3W4VSP1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Speer3W4VSP1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Speer3W4VSP1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Speer3W4VSP1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer3W4VSP1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer3W4VSP1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer3W4VSP1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer3W4VSP1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer3W4VSP1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer3W4VSP1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer3W4VSP1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Speer3W4VSP1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Speer3W4VSP1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Speer3W4VSP1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Speer3W4VSP1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Speer3W4VSP1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Speer3W4VSP1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Speer3W4VSP1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Speer3W4VSP1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Speer3W4VSP1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Speer3W4VSP1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Speer3W4VSP1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Speer3W4VSP1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Speer3W4VSP1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Speer3W4VSP1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Speer3W4VSP1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer3W4VSP1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer3W4VSP1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Speer3W4VSP1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Speer3W4VSP1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Speer3W4VSP1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Speer3W4VSP1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Speer3W4VSP1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Speer3W4VSP1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Speer3W4VSP1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Speer3W4VSP1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Speer3W4VSP1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Speer3W4VSP1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer3W4VSP1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Speer3W4VSP1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Speer3W4VSP1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer3W4VSP1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer3W4VSP1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Speer3W4VSP1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Speer3W4VSP1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Speer3W4VSP1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer3W4VSP1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer3W4VSP1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer3W4VSP1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer3W4VSP1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer3W4VSP1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Speer3W4VSP1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Speer3W4VSP1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Speer3W4VSP1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Speer3W4VSP1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Speer3W4VSP1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Speer3W4VSP1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Speer3W4VSP1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Speer3W4VSP1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Speer3W4VSP1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Speer3W4VSP1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Speer3W4VSP1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Speer3W4VSP1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Speer3W4VSP1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Speer3W4VSP1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Speer3W4VSP1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Speer3W4VSP1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Speer3W4VSP1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Speer3W4VSP1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Speer3W4VSP1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Speer3W4VSP1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Speer3W4VSP1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Speer3W4VSP1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Speer3W4VSP1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Speer3W4VSP1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Speer3W4VSP1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Speer3W4VSP1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Speer3W4VSP1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Speer3W4VSP1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Speer3W4VSP1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Speer3W4VSP1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Speer3W4VSP1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Speer3W4VSP1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Speer3W4VSP1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Speer3W4VSP1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Speer3W4VSP1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Speer3W4VSP1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Speer3W4VSP1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Speer3W4VSP1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Speer3W4VSP1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Speer3W4VSP1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Speer3W4VSP1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Speer3W4VSP1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Speer3W4VSP1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Speer3W4VSP1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Speer3W4VSP1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms