Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3550W4VSN7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm3550W4VSN7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm3550W4VSN7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm3550W4VSN7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm3550W4VSN7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm3550W4VSN7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm3550W4VSN7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3550W4VSN7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3550W4VSN7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3550W4VSN7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3550W4VSN7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3550W4VSN7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3550W4VSN7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3550W4VSN7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm3550W4VSN7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm3550W4VSN7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm3550W4VSN7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm3550W4VSN7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm3550W4VSN7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm3550W4VSN7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm3550W4VSN7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm3550W4VSN7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm3550W4VSN7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm3550W4VSN7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm3550W4VSN7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm3550W4VSN7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm3550W4VSN7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm3550W4VSN7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm3550W4VSN7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm3550W4VSN7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm3550W4VSN7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm3550W4VSN7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm3550W4VSN7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm3550W4VSN7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm3550W4VSN7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm3550W4VSN7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3550W4VSN7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3550W4VSN7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3550W4VSN7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3550W4VSN7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3550W4VSN7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3550W4VSN7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3550W4VSN7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm3550W4VSN7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3550W4VSN7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3550W4VSN7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3550W4VSN7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3550W4VSN7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3550W4VSN7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3550W4VSN7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3550W4VSN7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3550W4VSN7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3550W4VSN7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3550W4VSN7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3550W4VSN7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3550W4VSN7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3550W4VSN7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3550W4VSN7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3550W4VSN7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3550W4VSN7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3550W4VSN7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3550W4VSN7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3550W4VSN7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3550W4VSN7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3550W4VSN7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3550W4VSN7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3550W4VSN7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3550W4VSN7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3550W4VSN7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3550W4VSN7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3550W4VSN7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3550W4VSN7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3550W4VSN7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3550W4VSN7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3550W4VSN7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3550W4VSN7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3550W4VSN7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3550W4VSN7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3550W4VSN7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3550W4VSN7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3550W4VSN7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3550W4VSN7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3550W4VSN7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3550W4VSN7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3550W4VSN7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3550W4VSN7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3550W4VSN7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3550W4VSN7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3550W4VSN7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3550W4VSN7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3550W4VSN7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3550W4VSN7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3550W4VSN7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3550W4VSN7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3550W4VSN7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3550W4VSN7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3550W4VSN7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3550W4VSN7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3550W4VSN7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms