Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vstm4T1NXB5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vstm4T1NXB5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vstm4T1NXB5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vstm4T1NXB5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Vstm4T1NXB5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Vstm4T1NXB5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vstm4T1NXB5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vstm4T1NXB5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vstm4T1NXB5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vstm4T1NXB5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Vstm4T1NXB5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vstm4T1NXB5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vstm4T1NXB5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vstm4T1NXB5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vstm4T1NXB5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vstm4T1NXB5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vstm4T1NXB5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vstm4T1NXB5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vstm4T1NXB5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vstm4T1NXB5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Vstm4T1NXB5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vstm4T1NXB5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vstm4T1NXB5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Vstm4T1NXB5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vstm4T1NXB5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vstm4T1NXB5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vstm4T1NXB5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vstm4T1NXB5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vstm4T1NXB5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vstm4T1NXB5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vstm4T1NXB5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vstm4T1NXB5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vstm4T1NXB5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vstm4T1NXB5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vstm4T1NXB5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vstm4T1NXB5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vstm4T1NXB5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vstm4T1NXB5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Vstm4T1NXB5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vstm4T1NXB5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vstm4T1NXB5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vstm4T1NXB5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vstm4T1NXB5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vstm4T1NXB5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vstm4T1NXB5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vstm4T1NXB5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vstm4T1NXB5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vstm4T1NXB5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vstm4T1NXB5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vstm4T1NXB5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vstm4T1NXB5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vstm4T1NXB5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vstm4T1NXB5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vstm4T1NXB5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vstm4T1NXB5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Vstm4T1NXB5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vstm4T1NXB5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vstm4T1NXB5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vstm4T1NXB5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vstm4T1NXB5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vstm4T1NXB5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vstm4T1NXB5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vstm4T1NXB5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vstm4T1NXB5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vstm4T1NXB5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vstm4T1NXB5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vstm4T1NXB5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vstm4T1NXB5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vstm4T1NXB5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vstm4T1NXB5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vstm4T1NXB5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vstm4T1NXB5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vstm4T1NXB5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vstm4T1NXB5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vstm4T1NXB5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vstm4T1NXB5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vstm4T1NXB5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Vstm4T1NXB5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vstm4T1NXB5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vstm4T1NXB5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vstm4T1NXB5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vstm4T1NXB5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vstm4T1NXB5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Vstm4T1NXB5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vstm4T1NXB5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vstm4T1NXB5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vstm4T1NXB5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vstm4T1NXB5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vstm4T1NXB5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vstm4T1NXB5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vstm4T1NXB5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vstm4T1NXB5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vstm4T1NXB5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Vstm4T1NXB5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vstm4T1NXB5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vstm4T1NXB5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vstm4T1NXB5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vstm4T1NXB5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Vstm4T1NXB5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms