Protein–RNA interactions for Protein: S4R1A3

Gm26992, Predicted gene, 26992 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26992S4R1A3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm26992S4R1A3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm26992S4R1A3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm26992S4R1A3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm26992S4R1A3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm26992S4R1A3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm26992S4R1A3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm26992S4R1A3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm26992S4R1A3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm26992S4R1A3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm26992S4R1A3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm26992S4R1A3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm26992S4R1A3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm26992S4R1A3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm26992S4R1A3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm26992S4R1A3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm26992S4R1A3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm26992S4R1A3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm26992S4R1A3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm26992S4R1A3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm26992S4R1A3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm26992S4R1A3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm26992S4R1A3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm26992S4R1A3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm26992S4R1A3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm26992S4R1A3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm26992S4R1A3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm26992S4R1A3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm26992S4R1A3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm26992S4R1A3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm26992S4R1A3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm26992S4R1A3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm26992S4R1A3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm26992S4R1A3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm26992S4R1A3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm26992S4R1A3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm26992S4R1A3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm26992S4R1A3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm26992S4R1A3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm26992S4R1A3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm26992S4R1A3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm26992S4R1A3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm26992S4R1A3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm26992S4R1A3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm26992S4R1A3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm26992S4R1A3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm26992S4R1A3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm26992S4R1A3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm26992S4R1A3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm26992S4R1A3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm26992S4R1A3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm26992S4R1A3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm26992S4R1A3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm26992S4R1A3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm26992S4R1A3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm26992S4R1A3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm26992S4R1A3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm26992S4R1A3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm26992S4R1A3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm26992S4R1A3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm26992S4R1A3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm26992S4R1A3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm26992S4R1A3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm26992S4R1A3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm26992S4R1A3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm26992S4R1A3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm26992S4R1A3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gm26992S4R1A3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm26992S4R1A3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm26992S4R1A3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm26992S4R1A3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm26992S4R1A3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm26992S4R1A3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm26992S4R1A3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm26992S4R1A3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm26992S4R1A3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm26992S4R1A3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm26992S4R1A3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm26992S4R1A3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm26992S4R1A3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm26992S4R1A3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm26992S4R1A3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm26992S4R1A3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm26992S4R1A3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm26992S4R1A3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm26992S4R1A3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm26992S4R1A3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm26992S4R1A3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm26992S4R1A3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm26992S4R1A3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm26992S4R1A3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm26992S4R1A3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm26992S4R1A3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm26992S4R1A3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm26992S4R1A3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm26992S4R1A3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm26992S4R1A3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm26992S4R1A3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm26992S4R1A3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm26992S4R1A3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms