Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J6

Ptgdr2, Prostaglandin D2 receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgdr2Q9Z2J6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ptgdr2Q9Z2J6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ptgdr2Q9Z2J6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ptgdr2Q9Z2J6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ptgdr2Q9Z2J6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ptgdr2Q9Z2J6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ptgdr2Q9Z2J6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ptgdr2Q9Z2J6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ptgdr2Q9Z2J6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ptgdr2Q9Z2J6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ptgdr2Q9Z2J6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ptgdr2Q9Z2J6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ptgdr2Q9Z2J6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ptgdr2Q9Z2J6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ptgdr2Q9Z2J6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ptgdr2Q9Z2J6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ptgdr2Q9Z2J6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ptgdr2Q9Z2J6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ptgdr2Q9Z2J6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ptgdr2Q9Z2J6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ptgdr2Q9Z2J6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ptgdr2Q9Z2J6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ptgdr2Q9Z2J6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ptgdr2Q9Z2J6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ptgdr2Q9Z2J6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ptgdr2Q9Z2J6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ptgdr2Q9Z2J6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ptgdr2Q9Z2J6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ptgdr2Q9Z2J6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ptgdr2Q9Z2J6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ptgdr2Q9Z2J6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ptgdr2Q9Z2J6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ptgdr2Q9Z2J6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ptgdr2Q9Z2J6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ptgdr2Q9Z2J6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ptgdr2Q9Z2J6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ptgdr2Q9Z2J6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ptgdr2Q9Z2J6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ptgdr2Q9Z2J6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ptgdr2Q9Z2J6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ptgdr2Q9Z2J6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ptgdr2Q9Z2J6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ptgdr2Q9Z2J6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptgdr2Q9Z2J6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptgdr2Q9Z2J6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptgdr2Q9Z2J6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ptgdr2Q9Z2J6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ptgdr2Q9Z2J6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ptgdr2Q9Z2J6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ptgdr2Q9Z2J6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ptgdr2Q9Z2J6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ptgdr2Q9Z2J6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ptgdr2Q9Z2J6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ptgdr2Q9Z2J6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ptgdr2Q9Z2J6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ptgdr2Q9Z2J6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ptgdr2Q9Z2J6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ptgdr2Q9Z2J6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ptgdr2Q9Z2J6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ptgdr2Q9Z2J6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ptgdr2Q9Z2J6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ptgdr2Q9Z2J6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ptgdr2Q9Z2J6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ptgdr2Q9Z2J6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ptgdr2Q9Z2J6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ptgdr2Q9Z2J6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ptgdr2Q9Z2J6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ptgdr2Q9Z2J6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ptgdr2Q9Z2J6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ptgdr2Q9Z2J6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ptgdr2Q9Z2J6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ptgdr2Q9Z2J6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ptgdr2Q9Z2J6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ptgdr2Q9Z2J6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ptgdr2Q9Z2J6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ptgdr2Q9Z2J6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ptgdr2Q9Z2J6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ptgdr2Q9Z2J6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ptgdr2Q9Z2J6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ptgdr2Q9Z2J6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ptgdr2Q9Z2J6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ptgdr2Q9Z2J6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ptgdr2Q9Z2J6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ptgdr2Q9Z2J6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ptgdr2Q9Z2J6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ptgdr2Q9Z2J6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ptgdr2Q9Z2J6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ptgdr2Q9Z2J6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ptgdr2Q9Z2J6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ptgdr2Q9Z2J6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ptgdr2Q9Z2J6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms