Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B3

Rgr, RPE-retinal G protein-coupled receptor, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgrQ9Z2B3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RgrQ9Z2B3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RgrQ9Z2B3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RgrQ9Z2B3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RgrQ9Z2B3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RgrQ9Z2B3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RgrQ9Z2B3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RgrQ9Z2B3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RgrQ9Z2B3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RgrQ9Z2B3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RgrQ9Z2B3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RgrQ9Z2B3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RgrQ9Z2B3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RgrQ9Z2B3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RgrQ9Z2B3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RgrQ9Z2B3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RgrQ9Z2B3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RgrQ9Z2B3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RgrQ9Z2B3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RgrQ9Z2B3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RgrQ9Z2B3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RgrQ9Z2B3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RgrQ9Z2B3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RgrQ9Z2B3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RgrQ9Z2B3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RgrQ9Z2B3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RgrQ9Z2B3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RgrQ9Z2B3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RgrQ9Z2B3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RgrQ9Z2B3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RgrQ9Z2B3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RgrQ9Z2B3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RgrQ9Z2B3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RgrQ9Z2B3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RgrQ9Z2B3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RgrQ9Z2B3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RgrQ9Z2B3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RgrQ9Z2B3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RgrQ9Z2B3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RgrQ9Z2B3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RgrQ9Z2B3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RgrQ9Z2B3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RgrQ9Z2B3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RgrQ9Z2B3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RgrQ9Z2B3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RgrQ9Z2B3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RgrQ9Z2B3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RgrQ9Z2B3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RgrQ9Z2B3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RgrQ9Z2B3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RgrQ9Z2B3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RgrQ9Z2B3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RgrQ9Z2B3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RgrQ9Z2B3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RgrQ9Z2B3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RgrQ9Z2B3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RgrQ9Z2B3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RgrQ9Z2B3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RgrQ9Z2B3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RgrQ9Z2B3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RgrQ9Z2B3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RgrQ9Z2B3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RgrQ9Z2B3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RgrQ9Z2B3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RgrQ9Z2B3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RgrQ9Z2B3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RgrQ9Z2B3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RgrQ9Z2B3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RgrQ9Z2B3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RgrQ9Z2B3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RgrQ9Z2B3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RgrQ9Z2B3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RgrQ9Z2B3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RgrQ9Z2B3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RgrQ9Z2B3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RgrQ9Z2B3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RgrQ9Z2B3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RgrQ9Z2B3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RgrQ9Z2B3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RgrQ9Z2B3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RgrQ9Z2B3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RgrQ9Z2B3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RgrQ9Z2B3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RgrQ9Z2B3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RgrQ9Z2B3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RgrQ9Z2B3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RgrQ9Z2B3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RgrQ9Z2B3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RgrQ9Z2B3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RgrQ9Z2B3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RgrQ9Z2B3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RgrQ9Z2B3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RgrQ9Z2B3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RgrQ9Z2B3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RgrQ9Z2B3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RgrQ9Z2B3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RgrQ9Z2B3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RgrQ9Z2B3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RgrQ9Z2B3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RgrQ9Z2B3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms