Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Cldn6Q9Z262 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Cldn6Q9Z262 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Cldn6Q9Z262 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23,28■■□□□ 1,32
Cldn6Q9Z262 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Cldn6Q9Z262 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,27■■□□□ 1,32
Cldn6Q9Z262 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Cldn6Q9Z262 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,26■■□□□ 1,31
Cldn6Q9Z262 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Cldn6Q9Z262 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23,26■■□□□ 1,31
Cldn6Q9Z262 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Cldn6Q9Z262 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Cldn6Q9Z262 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Cldn6Q9Z262 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Cldn6Q9Z262 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23,25■■□□□ 1,31
Cldn6Q9Z262 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Cldn6Q9Z262 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Cldn6Q9Z262 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23,24■■□□□ 1,31
Cldn6Q9Z262 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Cldn6Q9Z262 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Cldn6Q9Z262 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Cldn6Q9Z262 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Cldn6Q9Z262 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23,21■■□□□ 1,31
Cldn6Q9Z262 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Cldn6Q9Z262 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,19■■□□□ 1,3
Cldn6Q9Z262 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Cldn6Q9Z262 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Cldn6Q9Z262 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Cldn6Q9Z262 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23,18■■□□□ 1,3
Cldn6Q9Z262 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23,18■■□□□ 1,3
Cldn6Q9Z262 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23,18■■□□□ 1,3
Cldn6Q9Z262 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Cldn6Q9Z262 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Cldn6Q9Z262 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Cldn6Q9Z262 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Cldn6Q9Z262 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23,15■■□□□ 1,3
Cldn6Q9Z262 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23,15■■□□□ 1,3
Cldn6Q9Z262 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
Cldn6Q9Z262 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Cldn6Q9Z262 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Cldn6Q9Z262 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Cldn6Q9Z262 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Cldn6Q9Z262 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Cldn6Q9Z262 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23,1■■□□□ 1,29
Cldn6Q9Z262 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Cldn6Q9Z262 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Cldn6Q9Z262 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23,09■■□□□ 1,29
Cldn6Q9Z262 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Cldn6Q9Z262 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,28
Cldn6Q9Z262 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Cldn6Q9Z262 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,06■■□□□ 1,28
Cldn6Q9Z262 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,06■■□□□ 1,28
Cldn6Q9Z262 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,06■■□□□ 1,28
Cldn6Q9Z262 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Cldn6Q9Z262 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Cldn6Q9Z262 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Cldn6Q9Z262 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23,03■■□□□ 1,28
Cldn6Q9Z262 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Cldn6Q9Z262 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Cldn6Q9Z262 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Cldn6Q9Z262 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Cldn6Q9Z262 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Cldn6Q9Z262 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Cldn6Q9Z262 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1,27
Cldn6Q9Z262 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1,27
Cldn6Q9Z262 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Cldn6Q9Z262 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,99■■□□□ 1,27
Cldn6Q9Z262 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Cldn6Q9Z262 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Cldn6Q9Z262 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Cldn6Q9Z262 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Cldn6Q9Z262 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Cldn6Q9Z262 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Cldn6Q9Z262 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22,97■■□□□ 1,27
Cldn6Q9Z262 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22,97■■□□□ 1,27
Cldn6Q9Z262 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Cldn6Q9Z262 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22,94■■□□□ 1,26
Cldn6Q9Z262 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22,94■■□□□ 1,26
Cldn6Q9Z262 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22,94■■□□□ 1,26
Cldn6Q9Z262 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22,94■■□□□ 1,26
Cldn6Q9Z262 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Cldn6Q9Z262 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Cldn6Q9Z262 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Cldn6Q9Z262 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Cldn6Q9Z262 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Cldn6Q9Z262 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Cldn6Q9Z262 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Cldn6Q9Z262 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Cldn6Q9Z262 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Cldn6Q9Z262 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,91■■□□□ 1,26
Cldn6Q9Z262 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Cldn6Q9Z262 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22,91■■□□□ 1,26
Cldn6Q9Z262 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Cldn6Q9Z262 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Cldn6Q9Z262 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22,89■■□□□ 1,25
Cldn6Q9Z262 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22,89■■□□□ 1,25
Cldn6Q9Z262 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
Cldn6Q9Z262 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Cldn6Q9Z262 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Cldn6Q9Z262 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22,87■■□□□ 1,25
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