Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24,08■■□□□ 1,45
Thbs4Q9Z1T2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Thbs4Q9Z1T2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24,07■■□□□ 1,44
Thbs4Q9Z1T2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24,07■■□□□ 1,44
Thbs4Q9Z1T2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Thbs4Q9Z1T2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,06■■□□□ 1,44
Thbs4Q9Z1T2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24,06■■□□□ 1,44
Thbs4Q9Z1T2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Thbs4Q9Z1T2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Thbs4Q9Z1T2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24,03■■□□□ 1,44
Thbs4Q9Z1T2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24,03■■□□□ 1,44
Thbs4Q9Z1T2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Thbs4Q9Z1T2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Thbs4Q9Z1T2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Thbs4Q9Z1T2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Thbs4Q9Z1T2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Thbs4Q9Z1T2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24■■□□□ 1,43
Thbs4Q9Z1T2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24■■□□□ 1,43
Thbs4Q9Z1T2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Thbs4Q9Z1T2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Thbs4Q9Z1T2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,98■■□□□ 1,43
Thbs4Q9Z1T2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23,98■■□□□ 1,43
Thbs4Q9Z1T2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Thbs4Q9Z1T2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Thbs4Q9Z1T2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Thbs4Q9Z1T2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Thbs4Q9Z1T2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Thbs4Q9Z1T2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23,96■■□□□ 1,43
Thbs4Q9Z1T2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Thbs4Q9Z1T2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23,95■■□□□ 1,43
Thbs4Q9Z1T2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Thbs4Q9Z1T2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,95■■□□□ 1,42
Thbs4Q9Z1T2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,95■■□□□ 1,42
Thbs4Q9Z1T2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Thbs4Q9Z1T2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Thbs4Q9Z1T2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23,93■■□□□ 1,42
Thbs4Q9Z1T2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23,92■■□□□ 1,42
Thbs4Q9Z1T2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Thbs4Q9Z1T2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23,9■■□□□ 1,42
Thbs4Q9Z1T2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Thbs4Q9Z1T2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23,89■■□□□ 1,41
Thbs4Q9Z1T2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23,89■■□□□ 1,41
Thbs4Q9Z1T2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23,89■■□□□ 1,41
Thbs4Q9Z1T2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Thbs4Q9Z1T2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23,88■■□□□ 1,41
Thbs4Q9Z1T2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Thbs4Q9Z1T2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23,87■■□□□ 1,41
Thbs4Q9Z1T2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23,86■■□□□ 1,41
Thbs4Q9Z1T2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23,86■■□□□ 1,41
Thbs4Q9Z1T2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Thbs4Q9Z1T2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23,85■■□□□ 1,41
Thbs4Q9Z1T2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23,85■■□□□ 1,41
Thbs4Q9Z1T2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23,84■■□□□ 1,41
Thbs4Q9Z1T2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Thbs4Q9Z1T2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Thbs4Q9Z1T2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Thbs4Q9Z1T2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,83■■□□□ 1,41
Thbs4Q9Z1T2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Thbs4Q9Z1T2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Thbs4Q9Z1T2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Thbs4Q9Z1T2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Thbs4Q9Z1T2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,81■■□□□ 1,4
Thbs4Q9Z1T2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,81■■□□□ 1,4
Thbs4Q9Z1T2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23,8■■□□□ 1,4
Thbs4Q9Z1T2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Thbs4Q9Z1T2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Thbs4Q9Z1T2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Thbs4Q9Z1T2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23,77■■□□□ 1,4
Thbs4Q9Z1T2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Thbs4Q9Z1T2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Thbs4Q9Z1T2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Thbs4Q9Z1T2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Thbs4Q9Z1T2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Thbs4Q9Z1T2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23,75■■□□□ 1,39
Thbs4Q9Z1T2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Thbs4Q9Z1T2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Thbs4Q9Z1T2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Thbs4Q9Z1T2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Thbs4Q9Z1T2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23,7■■□□□ 1,39
Thbs4Q9Z1T2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Thbs4Q9Z1T2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23,7■■□□□ 1,38
Thbs4Q9Z1T2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Thbs4Q9Z1T2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Thbs4Q9Z1T2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Thbs4Q9Z1T2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Thbs4Q9Z1T2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Thbs4Q9Z1T2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Thbs4Q9Z1T2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Thbs4Q9Z1T2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,67■■□□□ 1,38
Thbs4Q9Z1T2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Thbs4Q9Z1T2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23,67■■□□□ 1,38
Thbs4Q9Z1T2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Thbs4Q9Z1T2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Thbs4Q9Z1T2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Thbs4Q9Z1T2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
Thbs4Q9Z1T2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
Thbs4Q9Z1T2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,64■■□□□ 1,37
Thbs4Q9Z1T2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Thbs4Q9Z1T2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23,63■■□□□ 1,37
Thbs4Q9Z1T2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26,7 ms