Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syngr4Q9Z1L2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syngr4Q9Z1L2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syngr4Q9Z1L2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syngr4Q9Z1L2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syngr4Q9Z1L2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngr4Q9Z1L2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngr4Q9Z1L2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngr4Q9Z1L2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngr4Q9Z1L2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syngr4Q9Z1L2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Syngr4Q9Z1L2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syngr4Q9Z1L2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syngr4Q9Z1L2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syngr4Q9Z1L2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syngr4Q9Z1L2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syngr4Q9Z1L2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syngr4Q9Z1L2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Syngr4Q9Z1L2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syngr4Q9Z1L2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syngr4Q9Z1L2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syngr4Q9Z1L2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syngr4Q9Z1L2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syngr4Q9Z1L2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Syngr4Q9Z1L2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Syngr4Q9Z1L2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syngr4Q9Z1L2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syngr4Q9Z1L2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Syngr4Q9Z1L2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syngr4Q9Z1L2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syngr4Q9Z1L2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Syngr4Q9Z1L2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syngr4Q9Z1L2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syngr4Q9Z1L2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syngr4Q9Z1L2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Syngr4Q9Z1L2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syngr4Q9Z1L2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syngr4Q9Z1L2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syngr4Q9Z1L2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syngr4Q9Z1L2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syngr4Q9Z1L2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syngr4Q9Z1L2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syngr4Q9Z1L2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syngr4Q9Z1L2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syngr4Q9Z1L2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Syngr4Q9Z1L2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syngr4Q9Z1L2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Syngr4Q9Z1L2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syngr4Q9Z1L2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syngr4Q9Z1L2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syngr4Q9Z1L2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Syngr4Q9Z1L2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syngr4Q9Z1L2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syngr4Q9Z1L2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syngr4Q9Z1L2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syngr4Q9Z1L2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syngr4Q9Z1L2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syngr4Q9Z1L2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syngr4Q9Z1L2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syngr4Q9Z1L2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syngr4Q9Z1L2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syngr4Q9Z1L2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syngr4Q9Z1L2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syngr4Q9Z1L2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Syngr4Q9Z1L2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syngr4Q9Z1L2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syngr4Q9Z1L2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syngr4Q9Z1L2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syngr4Q9Z1L2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syngr4Q9Z1L2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syngr4Q9Z1L2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Syngr4Q9Z1L2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syngr4Q9Z1L2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Syngr4Q9Z1L2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syngr4Q9Z1L2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syngr4Q9Z1L2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syngr4Q9Z1L2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syngr4Q9Z1L2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syngr4Q9Z1L2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syngr4Q9Z1L2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syngr4Q9Z1L2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Syngr4Q9Z1L2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syngr4Q9Z1L2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syngr4Q9Z1L2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syngr4Q9Z1L2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syngr4Q9Z1L2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syngr4Q9Z1L2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syngr4Q9Z1L2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syngr4Q9Z1L2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syngr4Q9Z1L2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syngr4Q9Z1L2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syngr4Q9Z1L2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syngr4Q9Z1L2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syngr4Q9Z1L2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syngr4Q9Z1L2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syngr4Q9Z1L2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syngr4Q9Z1L2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syngr4Q9Z1L2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syngr4Q9Z1L2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syngr4Q9Z1L2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms