Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AireQ9Z0E3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AireQ9Z0E3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AireQ9Z0E3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AireQ9Z0E3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AireQ9Z0E3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AireQ9Z0E3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AireQ9Z0E3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AireQ9Z0E3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AireQ9Z0E3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AireQ9Z0E3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AireQ9Z0E3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AireQ9Z0E3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AireQ9Z0E3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AireQ9Z0E3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
AireQ9Z0E3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AireQ9Z0E3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AireQ9Z0E3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AireQ9Z0E3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AireQ9Z0E3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AireQ9Z0E3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AireQ9Z0E3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AireQ9Z0E3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AireQ9Z0E3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AireQ9Z0E3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AireQ9Z0E3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AireQ9Z0E3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AireQ9Z0E3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AireQ9Z0E3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
AireQ9Z0E3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AireQ9Z0E3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AireQ9Z0E3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AireQ9Z0E3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AireQ9Z0E3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AireQ9Z0E3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
AireQ9Z0E3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AireQ9Z0E3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AireQ9Z0E3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AireQ9Z0E3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AireQ9Z0E3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AireQ9Z0E3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AireQ9Z0E3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AireQ9Z0E3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AireQ9Z0E3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AireQ9Z0E3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AireQ9Z0E3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AireQ9Z0E3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AireQ9Z0E3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AireQ9Z0E3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AireQ9Z0E3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AireQ9Z0E3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AireQ9Z0E3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AireQ9Z0E3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
AireQ9Z0E3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
AireQ9Z0E3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AireQ9Z0E3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AireQ9Z0E3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AireQ9Z0E3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AireQ9Z0E3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AireQ9Z0E3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AireQ9Z0E3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AireQ9Z0E3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AireQ9Z0E3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AireQ9Z0E3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AireQ9Z0E3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AireQ9Z0E3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AireQ9Z0E3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AireQ9Z0E3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AireQ9Z0E3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AireQ9Z0E3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AireQ9Z0E3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AireQ9Z0E3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AireQ9Z0E3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AireQ9Z0E3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AireQ9Z0E3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AireQ9Z0E3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AireQ9Z0E3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AireQ9Z0E3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AireQ9Z0E3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AireQ9Z0E3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AireQ9Z0E3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AireQ9Z0E3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AireQ9Z0E3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AireQ9Z0E3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AireQ9Z0E3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AireQ9Z0E3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AireQ9Z0E3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AireQ9Z0E3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AireQ9Z0E3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AireQ9Z0E3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AireQ9Z0E3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AireQ9Z0E3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AireQ9Z0E3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AireQ9Z0E3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AireQ9Z0E3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AireQ9Z0E3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AireQ9Z0E3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AireQ9Z0E3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AireQ9Z0E3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AireQ9Z0E3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms