Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E0

Ncdn, Neurochondrin, mousemouse

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcdnQ9Z0E0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NcdnQ9Z0E0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NcdnQ9Z0E0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NcdnQ9Z0E0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NcdnQ9Z0E0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NcdnQ9Z0E0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NcdnQ9Z0E0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NcdnQ9Z0E0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NcdnQ9Z0E0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NcdnQ9Z0E0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NcdnQ9Z0E0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NcdnQ9Z0E0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NcdnQ9Z0E0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NcdnQ9Z0E0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NcdnQ9Z0E0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NcdnQ9Z0E0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NcdnQ9Z0E0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NcdnQ9Z0E0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NcdnQ9Z0E0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NcdnQ9Z0E0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NcdnQ9Z0E0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NcdnQ9Z0E0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NcdnQ9Z0E0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NcdnQ9Z0E0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NcdnQ9Z0E0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NcdnQ9Z0E0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NcdnQ9Z0E0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NcdnQ9Z0E0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NcdnQ9Z0E0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NcdnQ9Z0E0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NcdnQ9Z0E0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
NcdnQ9Z0E0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NcdnQ9Z0E0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NcdnQ9Z0E0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NcdnQ9Z0E0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NcdnQ9Z0E0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NcdnQ9Z0E0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NcdnQ9Z0E0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NcdnQ9Z0E0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NcdnQ9Z0E0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NcdnQ9Z0E0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NcdnQ9Z0E0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NcdnQ9Z0E0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NcdnQ9Z0E0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NcdnQ9Z0E0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NcdnQ9Z0E0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NcdnQ9Z0E0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NcdnQ9Z0E0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NcdnQ9Z0E0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NcdnQ9Z0E0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NcdnQ9Z0E0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NcdnQ9Z0E0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NcdnQ9Z0E0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NcdnQ9Z0E0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NcdnQ9Z0E0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NcdnQ9Z0E0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NcdnQ9Z0E0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NcdnQ9Z0E0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NcdnQ9Z0E0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NcdnQ9Z0E0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NcdnQ9Z0E0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NcdnQ9Z0E0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NcdnQ9Z0E0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NcdnQ9Z0E0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NcdnQ9Z0E0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NcdnQ9Z0E0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NcdnQ9Z0E0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NcdnQ9Z0E0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NcdnQ9Z0E0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NcdnQ9Z0E0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NcdnQ9Z0E0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NcdnQ9Z0E0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NcdnQ9Z0E0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NcdnQ9Z0E0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NcdnQ9Z0E0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NcdnQ9Z0E0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NcdnQ9Z0E0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NcdnQ9Z0E0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NcdnQ9Z0E0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NcdnQ9Z0E0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NcdnQ9Z0E0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NcdnQ9Z0E0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NcdnQ9Z0E0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NcdnQ9Z0E0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NcdnQ9Z0E0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NcdnQ9Z0E0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NcdnQ9Z0E0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NcdnQ9Z0E0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NcdnQ9Z0E0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NcdnQ9Z0E0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NcdnQ9Z0E0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NcdnQ9Z0E0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NcdnQ9Z0E0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NcdnQ9Z0E0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NcdnQ9Z0E0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NcdnQ9Z0E0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NcdnQ9Z0E0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NcdnQ9Z0E0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NcdnQ9Z0E0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NcdnQ9Z0E0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms