Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Stxbp4Q9WV89 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Stxbp4Q9WV89 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28,3■■■□□ 2,12
Stxbp4Q9WV89 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Stxbp4Q9WV89 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Stxbp4Q9WV89 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Stxbp4Q9WV89 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Stxbp4Q9WV89 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28,27■■■□□ 2,12
Stxbp4Q9WV89 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Stxbp4Q9WV89 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28,24■■■□□ 2,11
Stxbp4Q9WV89 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Stxbp4Q9WV89 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Stxbp4Q9WV89 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Stxbp4Q9WV89 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Stxbp4Q9WV89 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Stxbp4Q9WV89 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Stxbp4Q9WV89 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Stxbp4Q9WV89 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Stxbp4Q9WV89 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28,2■■■□□ 2,11
Stxbp4Q9WV89 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Stxbp4Q9WV89 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Stxbp4Q9WV89 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Stxbp4Q9WV89 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,19■■■□□ 2,1
Stxbp4Q9WV89 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Stxbp4Q9WV89 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Stxbp4Q9WV89 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Stxbp4Q9WV89 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Stxbp4Q9WV89 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Stxbp4Q9WV89 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Stxbp4Q9WV89 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Stxbp4Q9WV89 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Stxbp4Q9WV89 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
Stxbp4Q9WV89 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
Stxbp4Q9WV89 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Stxbp4Q9WV89 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Stxbp4Q9WV89 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Stxbp4Q9WV89 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Stxbp4Q9WV89 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Stxbp4Q9WV89 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Stxbp4Q9WV89 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Stxbp4Q9WV89 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Stxbp4Q9WV89 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Stxbp4Q9WV89 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Stxbp4Q9WV89 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Stxbp4Q9WV89 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Stxbp4Q9WV89 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Stxbp4Q9WV89 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Stxbp4Q9WV89 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28,03■■■□□ 2,08
Stxbp4Q9WV89 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Stxbp4Q9WV89 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Stxbp4Q9WV89 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Stxbp4Q9WV89 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Stxbp4Q9WV89 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Stxbp4Q9WV89 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Stxbp4Q9WV89 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2,07
Stxbp4Q9WV89 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Stxbp4Q9WV89 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Stxbp4Q9WV89 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27,99■■■□□ 2,07
Stxbp4Q9WV89 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Stxbp4Q9WV89 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,99■■■□□ 2,07
Stxbp4Q9WV89 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27,98■■■□□ 2,07
Stxbp4Q9WV89 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Stxbp4Q9WV89 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Stxbp4Q9WV89 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Stxbp4Q9WV89 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Stxbp4Q9WV89 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27,97■■■□□ 2,07
Stxbp4Q9WV89 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Stxbp4Q9WV89 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Stxbp4Q9WV89 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27,95■■■□□ 2,06
Stxbp4Q9WV89 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Stxbp4Q9WV89 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Stxbp4Q9WV89 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Stxbp4Q9WV89 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Stxbp4Q9WV89 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Stxbp4Q9WV89 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Stxbp4Q9WV89 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Stxbp4Q9WV89 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Stxbp4Q9WV89 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Stxbp4Q9WV89 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Stxbp4Q9WV89 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Stxbp4Q9WV89 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Stxbp4Q9WV89 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Stxbp4Q9WV89 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Stxbp4Q9WV89 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Stxbp4Q9WV89 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Stxbp4Q9WV89 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Stxbp4Q9WV89 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27,86■■■□□ 2,05
Stxbp4Q9WV89 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27,86■■■□□ 2,05
Stxbp4Q9WV89 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Stxbp4Q9WV89 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Stxbp4Q9WV89 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Stxbp4Q9WV89 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27,83■■■□□ 2,05
Stxbp4Q9WV89 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Stxbp4Q9WV89 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Stxbp4Q9WV89 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Stxbp4Q9WV89 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Stxbp4Q9WV89 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Stxbp4Q9WV89 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Stxbp4Q9WV89 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Stxbp4Q9WV89 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27,81■■■□□ 2,04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,6 ms